人类灭绝-第22章
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“请讲。”
“我明白你父亲制定这个计划时的想法。”
“什么？”研人惊愕地探出身子。
“成功实施这个看似不可能实现的计划的条件只有一个，即‘gift’这个软件十全十美。”
“十全十美？”
正勋点头道：“如果能准确建立受体模型，并完美设计出与其结合的药物的化学结构，那接下来只需按部就班地操作就行了。”
“就是说，接下来只需要按照药物的化学结构将其合成出来？”
“不错，所以说，你父亲制定的研究步骤，是成功合成药物的最基本条件。”
如果制药软件能生成完美的设计图，那合成出化合物就等于制造出药物。姑且不论假设是否成立，单从逻辑角度看，这一论断确实没错。
a4大小的白色笔记本电脑中有必要的软件，就使用这台笔记本吧。
原来父亲在遗书中，给出了充分的指示。正勋说得对，只要“gift”软件十全十美，父亲的计划肯定就能成功实施。
“可这个世界上有那么强大的软件吗？”
“没有。”正勋断然否定。
研人大失所望，“那逻辑上成立有什么用？”
“我那么说是出于对你父亲的尊敬。”正勋笑道，朝更大的电脑伸出手，“咱们看看‘gift’软件吧。”
电脑很快启动，屏幕上浮现出“变种gpr769”的cg图像。正勋惊叫起来：“这是什么？”
“从专业角度看，果然很奇怪？”
“我还从没见过如此真实的图像。唔……怎么说呢？这么设计还是有道理的。”
正勋注视着七个α螺旋组成的跨膜结构受体，过了好一阵子，他才移动鼠标，敲击键盘，确定“gift”的各项功能，嘴里不时嘟哝着“原来如此”或“怎么回事”，间或还笑出声来。查看完毕后，正勋说：“真是不可思议！这个软件领先了当今科学水平五十年。以现代人类的水平，不可能写出这样的软件。”
“就是说，它超越了人类智慧？”
“对，超越了人类的智慧。通过基因的碱基序列，就能知晓受体蛋白质的立体结构，从而设计与其结合的药物的化学结构，还可以预测药物与受体结合后的复合体的结构。对了，这是什么？”
第14章 海斯曼报告（13）
菜单中有一个写着“admet”的选项。这一术语同研人的专业有关。“这是吸收、分配、代谢、排泄和毒性等五个英文单词的首字母缩写，是药物进入体内后的状态指标。”
“哦……”正勋似乎明白了，“是药物在体内的动态和毒性吧？”
“这个软件，连‘admet’都可以预测？”
“嗯，光看这个功能，并没什么好稀奇，因为其他软件也能预测药物在体内的动态和毒性。但‘gift’还可以指定生物种类，选择人或鼠。还有基因组输入栏，必要时实施定制医疗。”
研人也开始真切意识到“gift”这个软件有多么不同寻常。“如果这个软件十全十美，那就不需要临床试验了。”
“嗯。整个制药工程都可以由这个万能软件承担。人要做的，只是合成药物和确认结果而已。”
研人和正勋相视而笑。
“接下来——”正勋再次看向电脑，似乎对这个神奇的软件倍感兴趣，“我们来找找这个软件并不完美的证据吧。你有什么好办法？”
“不知道这个有没有用？”研人将塞在书架上的一摞纸拿出来，那是实习医生吉原下载的肺泡上皮细胞硬化症的相关论文。“葡萄牙的研究人员发布了刚才提到的那种受体的立体结构。”
正勋浏览了一遍论文，喃喃道：“是同源建模啊？太好了。”然后反复比对“gift”中的图像。真实的cg图像变成了由球和带组成的抽象模型。将受体的活性部位放大后，与配体结合的部分就从原子层面上显示出来。
“果然如此。”正勋说，“两种模型差别很大。原子坐标的数值也不一样。”
“这么说，‘gift’是骗人的？”
正勋却苦着脸说：“现在还不知道。从逻辑上说，有三种可能：葡萄牙的研究人员错了，或者‘gift’错了，或者两者都错了。”
研人对正勋不肯轻易下判断的态度深表敬佩。强大的逻辑思维能力是科学工作者唯一的武器。
“其实，计算机辅助药物设计已经遇到了瓶颈。就算是最先进的软件，也很难准确预测膜蛋白质的立体结构。葡萄牙的博士多半也使用了错误的模型。”
正勋打开自己笔记本电脑中的软件，拷贝了碱基序列的信息，输入“gift”。“这种蛋白质的结构是已知的，我们来做个试验，对比一下‘gift’生成的结果吧。”
敲击回车键后，屏幕上出现了一串英文：请连入因特网。
“这是为什么？”正勋不解地问。
研人将高速因特网的网线接入a4大小的白色笔记本电脑。机器接入赛博空间后，“gift”的画面也改变了。
remaintime00：03：11
这个数字正在逐秒递减。
“只要三分钟？”正勋嘟哝道。
三分钟后，“gift”就给出了答案。窗口中浮现出正勋指定的蛋白质的立体结构。正勋仔细比对，神情越来越严肃。“奇怪，这个软件准确描绘了一百个氨基酸构成的蛋白质的结构。”
研人也惊讶不已。这不就证明了“gift”是完美的吗？
但正勋仍然没有立即下结论。
“我首先想到的是，这个软件是冒牌货。”
“那它怎么能模拟出蛋白质的结构？”
“它要求在计算时连上因特网，对吧？”
“嗯。”
“它可能找到网上已有的蛋白质结构，假装是自己计算的结果。只要接入蛋白质数据库，就能找到许多类似的信息。”
“原来如此。”研人说，但马上又发现了新问题，“可是这样一来，我们不是就无法判断‘gift’的真伪了吗？”
“不错。我们无法辨别‘gift’是自己计算出正确的结果，还是盗用了别人的发现，因为正确的结构只有一种。但如果计算未知的结构，那谁都不知道‘gift’和其他的模型谁对谁错。”
他们似乎中了一个狡猾至极的圈套。不过，倘若“gift”是冒牌货，那到底是谁出于何种目的，大费周章地开这种玩笑？
正勋问：“你父亲熟悉编程吗？”
“完全不懂。”
“那他是从哪里得到这个软件的？”
“不知道。”
礼物——这个软件的名字，渐渐飘散出阴森的气息。
“还有一种可能，即‘gift’确实是十全十美的。当然，这只是假设。”正勋强调道，“如果这一假设成立，那‘gift’就可能是装有云系统的黑客软件。”
“云系统？”
“是的。这是寻找外星人的‘seti计划’用的方法。要从宇宙电波中探测出可能是智慧生命发射的信号，需要异常庞大的计算量。于是该计划招募了大量志愿者，将他们的电脑联网，利用他们电脑cpu的一部分进行计算。数十万台电脑集中起来的话，其计算能力将超过超级计算机。”
“我能说句题外话吗？”
“可以。”
“他们有没有找到外星人？”
“还没有。”
研人有点失望。
“银河系中心发出的来历不明的电波，过去只检测出六次。现在这些电波仍然是个谜。世界各国的天文学家，已经制定了报告程序，应对找到外星人的情况。”
“哦。”
“言归正传。”
正勋迅速将关注点从外星人转移到“gift”上。
“决定软件性能的重要因素有两个：电脑的计算能力和算法。”
“算法指的就是计算步骤吧？”
“不错。省略无用的计算，用更少的步骤获得正确的答案。”
研人拼命思考，理解这些非专业知识。
“如果这台电脑接入了分布式计算系统，将计算任务分配给其他电脑，那计算能力就会大大提高。但是，即便将一亿台电脑连起来，也不可能完成分子动力学模拟计算。”
这一点研人也明白。正因为计算不完美，才要在制药过程中收集与结构活性相关的数据，研究更合适的化学结果。发达国家之所以争相研制超级计算机，也是因为计算能力与科学技术水平直接相关的时代已经来临。
“能弥补计算能力不足的，是简化计算步骤，也就是算法。尽管使用了各种方法，但完美的算法是不存在的。算法不同，答案也会不同。这就是当今科学的局限性。换言之，目前人类所掌握的计算能力还不够强，也没人发现完美的计算步骤。”正勋做出结论。
研人道：“也就是说，‘gift’不可能十全十美。”
“根据常识判断，应该如此。”正勋答道，但脸上依然带着不确定的神色。
“你还有什么疑惑？”
正勋的话突然含糊起来：“怎么说好呢，那种感觉……”
“感觉？”
“嗯……这个软件，用起来感觉很奇怪。”
“怎么说？”
“唔……怎么说呢？”正勋揪着头发，将他心中异样的感觉翻译成日语，“用的时候觉得，这软件真像是万能的。”
这种感觉，恐怕只有精通软件的正勋才明白吧。
“开发这个软件的，应该是非常优秀的研究人员。从表面上看，他对分子层面和电子层面极其复杂的生命活动都了若指掌。倘若这个软件真的能用，那授予开发者多少个诺贝尔奖都不为过。”
研人也有同感。
“不过，好像也没有直接证据表明，这个软件是冒牌货。这软件设计得太巧妙了。”
“开发这个软件的人有何目的呢？”
“这也是个谜。在专家�
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